医院和德国癌症研究中心研究者为首的国际团队利用分子诊断的方法，已经确定了四个疑似中枢神经系统原始神经外胚层瘤(CNS-PNET)的新亚型。
CNS-PNETs起因于中枢神经系统中极端不成熟和未分化的组织。这些肿瘤非常罕见且具有侵袭性，并且患病的大多数是儿童。虽然它们只占儿童脑瘤的一小部分，但根据NIH的统计结果，被诊断患有CNS-PNET肿瘤的儿童的五年生存期只有40%~60%。
圣裘德神经病理学家，文章第一作者BrentOrr说，群体数量太少是研究罕见癌症和疾病的一大难点。虽然CNS-PNETs在全球范围内的发病率非常低，但是这项研究的国际性质能够确保我们有足够的群体数量来进行研究。
Orr说，诊断和治疗CNS-PNETs难点是，很难将它们与高级神经胶质瘤区分开，这对确定患者最有效的治疗方法是非常重要的，因为CNS-PNETs通常利用全脑脊髓辐射进行治疗，而高级神经胶质瘤通常利用局部放射疗法进行治疗。
在该项研究中，研究人员收集了归类为CNS-PNET的个肿瘤的组织，以及来自枚被准确定义的参考脑瘤的组织，这些脑瘤是非CNS-PNET类的。他们利用Illumina公司的Human-MethylationBeadChiparray对这两组组织样本进行了DNA甲基化分析。
根据甲基化分析的结果，研究团队发现，61%的CNS-PNETs可以被重新归类为一种不同类型的脑瘤，例如高级神经胶质瘤，室管膜瘤和非典型畸形样瘤/横纹肌样瘤。在很多情况下，肿瘤的重新分类意味着一个完全不同的治疗方案。
其余的CNS-PNETs分析结果中，研究人员发现，大多数属于四个不同亚组中的一组，并且每个都有独特的基因变异，包括基因重排，删除和扩增。
研究人员也分析和寻找样本间的联系，来验证甲基化分析结果与这四类CNS-PNET亚型其他遗传特征的相关性。
他们也提取了组织样本的DNA和RNA，并且利用Illumina公司的仪器对其进行测序，以便获取这四种CNS-PNET亚型的更全面的基因理解，并揭示子群特定的突变。当研究人员分析基因表达数据时，他们发现了在肿瘤细胞中已被破坏的，其他种类子群特定的通路差异，这可以作为开发药物的靶标。
研究人员也注意到，肿瘤亚型和治疗效果也随着病人的年龄和性别的不同而不同。他们相信，这表明该肿瘤可能会对不同的靶向治疗有响应。
Orr说，“目前的挑战是如何把这些分子诊断技术转化到临床应用上，它们目前并没有在临床上被验证。”
然而，Orr和他的同事们也指出，他们已经开始开展关于结合分子标记来定制临床实验应用于CNS-PNETs分类和诊断的工作。
文章来源：GenomeWeb
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